Bai’at adalah kegiatan dimana para santri PPI 98 Pasirjeungjing bekumpul dan secara bersama-sama mengucap janji setianya kepada Allah SWT dihadapan para asatidz (guru).
Sebagai sarana dakwah, pesantren dalam hal ini berikhtiar untuk mengarahkan santrinya dalam segala aktivitas yang didasarkan pada prinsip Al-Qur’an dan As-Sunnah. Dari mulai bangun tidur hingga tidur lagi, seluruh kegiatannya bermanfaat dan tentunya menghasilkan pahala yang akan menjadi bekal dalam mengarungi kehidupan akhirat kelak.
Kegiatan bai’at ini menjadi adat kebiasaan bukan hanya di PPI 98 Pasirjeungjing, namun di seluruh pesantren Persis. Para santri mengucapkan isi bai’at yang kebanyakan berisi tentang pembinaan karakter. seperti dibiasakan tidak berbohong, tidak mengejek sesama makhluk, tidak mencuri, tidak bersikap sombong, tidak bertengkar dan sebagainya.
Setelah pengucapan bai’at selesai para santri akan diberikan khutbah singkat atau nasihat-nasihat berharga serta motivasi-motivasi yang akan membangun semangat dari kelas 3 Mu’allimien baik dari RG maupun UG ataupun dari para asatidz.